雙連長老教會有感於大直內湖社區發展迅速，長老教會信徒與外來遷入者日漸增加，有在大直開拓教會的必要，而決定於1977年底開設教會，並積極尋覓聚會地點和開拓傳教師。直到1978年二月下旬才覓得北安路595巷2弄1號二樓，租屋作為禮拜堂，並聘請陳宏文牧師(原新竹中會新屋教會牧師)前來擔任開拓工作。同年四月九日開始大直教會第一次聚會，共有十人參加，至4月30日由七星中會派員前來本會舉行開設禮拜，正式命名為「台灣基督長老教會大直教會」。
本會開設後，經由陳宏文牧師努力開拓牧養及雙連母會的協助，至1980年七月聚會人數漸多，已達45名左右(在籍陪餐者18名)，並選出張黃秀紅、蕭謝素緣、黃光武、歐陽博等四名委員。1980年七月底，陳宏文牧師應聘至花蓮港教會牧會。因此七星中會派遣甫自台灣神學院畢業的康滄海傳道師至本會接續牧會工作，至1981年一月，聚會人數已達48名(在籍陪餐者30名)。
陳牧師牧會期間極力向雙連母會爭取購置禮拜堂，卻因重重困難而未能完成。經康傳道與會友同心協力，終於在1981年六月始購得北安路630巷5號一樓的房屋作為禮拜堂，8月2日第一次在新堂聚會，直到1982年2月14日舉行獻堂典禮。此後本會教勢日盛，為充分運用空間，又在1982年十月重新調整禮拜堂內的位置擺設。
1983年八月底，康滄海傳道師出國深造。在無牧者期間，由雙連教會賴俊明牧安排主日禮拜講道者。本會已符合升格堂會資格，於1983年12月11選出第一任長執，長老二名：施樹木、姚榮信；執事五名：李兆然、蕭明德、邱得一、柯尚德、黃珊。並請雙連母會向七星中會申請升格為堂會，後經七星中會第三十二屆第十一次中委會議決通過，准予本會升格堂會。
1984年1月8日長執會通過購置北安路638號二樓作為牧師館，雙連母會同意補助十萬元，另無息貸款六十萬元，得以順利購買。1984年2月12日，通過監選簡茂雄牧師為本會第一任牧師，並於4月29日下午三時舉行設教六週年、升格堂會及簡茂雄牧師就任第一任牧師三項慶典的感恩禮拜，使本會邁向新的里程。1985年12月開始租用北安路638號一樓作為教育館，提供主日學及各團契聚會使用，1986年十一月整建教育館兒童室，增加視聽設備。
1987年二月開始實施家庭增長小組，分為大直、內湖、麗山三組。同年十月又購置福音車，以利教會事工推展。1988年4月24日本會舉行設教十週年感恩禮拜，並編印設教十週年紀念特刊。
1989年8月16日小會同意簡茂雄牧師任期屆滿離職，前往台中中會北屯教會牧會。九月起七星中會派吳興教會詹燦東牧師擔任本會小會議長，至1990年4月12日本會聘牧小組通過聘請朱錫安牧師，並於5月20日舉行臨時會員和會，通過監選朱錫安牧師為本會第二任牧師，並於9月30日正式就任。
1992年開始喚起信徒購買教育館的異象，積極籌募教育館基金。1993年是本會設教十五週年，9月5日舉行臨時會員大會，通過朱錫安牧師續任監選，任期三年。但這一年也面臨諸多挑戰，包括禮拜堂地基受損、福音車失竊、教育館購買舉棋未定等。1994年較遺憾而值得深思的問題是無人受洗或堅信禮。
1996年8月30日小會同意朱錫安牧師任期屆滿離職，前往台南中會安南教會牧會。九月份起七星中會派雙連教會彭德貴牧師擔任本會小會議長，十一月份起邀請更生團契副總幹事姚榮輝牧師開始在主日禮拜中講道，並主理查經祈禱會等聚會。
1997年8月3日起，七星中會派遣台灣神學院畢業的蔡幸昇傳道師(原在大安教會擔任四十三屆總會議長羅聯昇牧師助理傳道)前來本會接任，繼續牧養的工作。1998年欣逢本會設教二十週年，除了編印設教二十週年紀念特刊外，也借雙連教會盛大舉行設教二十週年感恩禮拜與蔡幸昇教師封牧暨就任第三任牧師授職禮拜。
1999年至2001年推動信徒讀經、祈禱的靈修生活，除了完成三年一輪的「新眼光讀經運動」，也持續每週二清晨六時的早禱會及週五的復興禱告會。同時在長執會的架構下，透過事工部(包括傳道、禮拜、教育、服務、總務、財務六部)的計劃與執行，讓長執與信徒分工合作，共同參與教會事奉。
2001年的年度主題是「建造教會．興旺福音」，一月九日簽約購買禮拜堂及教育館，順利完成裝潢工程，於11月11日舉行獻堂禮拜。2002至2003年度主題是「事奉獻身．興旺福音」，包括硬體(有形的教會)與軟體(宣教的策略)雙管齊下的建造，裝備訓練同工，積極推動社區事工，領人歸主。2002年十月，與太平洋建設公司簽約，承租北安路655號2樓之2作為教育二館，經過五年已於2006年十二月底正式簽約購買該館，同時租用教育三館(北安路655號2樓之3)作為主日學事工和教育裝備聚會，以及未來推動社區事工發展的場所。2003年七月起開始第二場華語禮拜，並加強關懷、探訪事工。2011年1月25日小會投票通過聘請施貞同牧師為教育牧師，並於4月17日舉行就任授職感恩禮拜。2011年8月購買北安路655號1樓作為Touch Love社區宣教中心，於2012年7月底裝潢完工正式啟用，提供裝備訓練及服務社區，成為社區人士踏入教會，福音廣傳的管道。2012至2013年教會主題是「遍傳基督福音．活出健康教會」。
2013年8月31日蔡幸昇牧師任滿轉任新竹中會南崁教會，施貞同牧師轉任台北中會艋舺教會，9月1日召開臨時會員和會，監選林憲懋牧師為本會第4任主任牧師，隨後召開小會監選吳昭誼牧師為教育牧師，並於11月17日下午舉行就任感恩禮拜。2014至2015年教會主題是「奮勇追隨基督，活出健康教會」。
經過禱告與尋求，上帝給林牧師的異象是「以信立教會，以望事社區，以愛呵護家」，而2016年及2017年兩年的年度主題是「喜樂做主門徒，積極委身侍奉」，呼應台灣基督長老教會總會的年度主題「同心合一學基督，謙卑服事做忠僕」，正是上帝奇妙的旨意及帶領。
2018年，本會慶祝「設教40週年」，透過各項具體行動，向上主獻上感謝祭。「40週年慶核心團隊」，透過固定時間的聚集、禱告、開會、計畫與推動時程，與弟兄姐妹們一同經歷那超乎我們所求所想的恩典。
2019年，我們以「人人活潑宣教，領受天國福鑰」作為年度主題，而年度目標則是「建造領袖，群體更新」，因為我們深感為主建立起服事團隊的重要性和急迫性，在禱告尋求中，清楚明白上主的心意，我們必須在各級侍奉單位之中，為主建造門徒，鼓勵大家一起接受裝備，面對新的世代與挑戰，更有信心與勇氣，喜樂的服事，為主所用。希望在每一位弟兄姐妹的身上，因為一點一滴的改變、生命的突破，帶來屬天的祝福。如果我們真能在自己的身上，看見突破，哪怕只是小小的改變與進步，這等動力將會累積成巨大的信心能量，保守我們常在主的恩典中。
在主美好旨意的安排之下，2019年10月，本會聖歌隊憑信心跨出事奉的步伐，受邀前往馬來西亞詩巫，在當地衛理公會天道堂舉行為期6天的短宣侍奉，看到當地教區眾教會渴慕在聖樂事奉的領域中，更得精進，又看到我們同在主裡可以互為肢體、彼此鼓勵、謙卑學習，真是美得無比的畫面。此行不僅讓同行的弟兄姊妹們，強烈感受到聖靈的同在與同工，更是把在當地事奉所得到的感動與祝福，帶回台灣、帶回教會，鼓舞全體弟兄姊妹，更火熱愛主、愛事奉、愛靈魂。
喜迎2020年的來到，我們滿懷盼望與期許，盼望上帝豐盛的慈愛與恩惠，常與我們眾人同在，期許聖靈恩膏，滿滿澆灌，讓我們滿有信心，跟隨主、服事這美好的天父世界。
2020年～2021年，我們的年度主題是「全人健康教會，成為萬民祝福」，盼望我們的身心靈蒙上帝賜福，健全喜樂，並且使用我們的生命，成為萬人的祝福與幫助。2020年度目標是「持續更新，全人健康」，期待在新的一年當中，我們追求靈命更新的腳步不停歇，為此我們廣邀國內外講師，分享他們個人或牧會生涯之中，經歷上帝奇妙豐富的供應，盼望如同雲彩般的見證，成為我們信心腳步的鼓勵。
2019年12月中旬，在人們完全沒有心理準備的情況之下，發生了世紀大疫「武漢肺炎」（COVID-19），至今仍在影響著全世界。
因著疫情擴散至全球，且其影響層面既廣且深，我教會同工靠著主的憐憫與恩典，配合政府防疫措施，因應避免因群聚而可能產生的疫情傳播，我們決定暫停了「實體聚會」，包括社區松年大學也暫停一學期來應對之。
從3月～5月初，我們共暫停了9次的實體禮拜，改為利用每週六全天的時間，同工一起參與，預錄隔天禮拜的所有內容，並鼓勵會友各自在家中，以「線上」的方式參與主日禮拜。儘管如此，我們原本所擔憂的，如人數、奉獻、參與侍奉人力等可能因疫情衝擊而減少，但主都看顧、保守，以致於不但沒有減少，反而豐盛有餘！各小組、各級會議同樣也因疫情緣故，暫時改為線上方式進行，上主奇妙的方式，開啟了新的視野、新的嘗試，也在過程中看到同工專業、用心和積極，實在是恩典滿滿。
疫情無情襲擊，世界各地不時傳來傷亡消息，我們雖然也擔憂，但學習將焦點放在神的身上，越是在不平安的世代裡，越是更真實體會到主同在的重要。我們憑信心，推動「遇見神營會、裝備課程更新化」，這是為了更接近本會實況和需要，教牧團隊著手重新編寫課程內容，並且在2020年中，依序推動課程進行且順利完成，與弟兄姊妹一同學習。
2020年中，台灣疫情趨緩，我們忠心地完成各項事工，並且在過程中仍不斷學習仰望神、依靠主，憑信心領受神的供應和賜福。國外短宣雖因疫情無法舉辦，但國內短宣事工（恆基）仍如常舉行，感謝神讓我們有服事的機會。
為了慶祝救主耶穌基督2020年聖誕，禮拜部與宣教部同工，一起計畫、推動「在街角聽見聖誕的聲音」–是為2020年聖誕音樂晚會，並在12/24及12/25兩個晚上舉行，我們嚴謹地遵守政府防疫措施（按照實聯制方式進行），同工們用心地準備，也在美好而豐富多元的音樂聲中，在樂手真實動人的分享裡，我們一同見證主耶穌所賞賜的平安，不是這世界所能給的平安，是人心所渴望的「真平安」。
2020年，真是叫人難忘，可說是由「恐懼擔憂和信心仰望」交織而成的一年，我們一面為著世界局勢感到憂心，另一方面卻看到神奇妙無比的作為，保守台灣這個美麗島國，得以在不安當中，我們卻仍有平安，可以過正常的生活。
進入2021年，我們仍在面對這世界的眾多挑戰，懇求主保守我們，藉著同心禱告、積極侍奉、參與聖工、服事社區、全家歸主等各項行動，不僅回應主愛，也體會上主的奇妙權能，同心合意建立大直教會成為一間健康、強盛、榮耀的教會，並落實大誡命愛神愛人，完成福音遍傳的大使命。
2021年4月30～5月1日，全體長執、領袖同工，在神的帶領與預備之下，我們一同前往新竹聖經學院舉辦「領袖共識營」，邀請陳伯杰牧師夫婦，來帶領我們透過禱告、溝通，一起尋求上帝在我們的旨意。感謝讚美主，兩天一夜豐富而充實的課程與活動內容，眾同工迫切同心的禱告仰望，我們相信上帝將大直教會未來10年的異象，匯聚成「全人健康帶門徒，敬神相愛傳福音，靈火禱告榮耀主」，這是我們教會的異象，是我們遵循前行的目標。
5月15日，中國武漢肺炎疫情發生社區傳播，短時間內快速傳染的結果，使政府緊急宣布升級為三級管制。為配合政府相關公共衛生法令及規定，我教會也改為「線上禮拜」，每個週六進行預錄，並於週日上午9：30及11：00準時播出，兒童牧區也同樣以線上方式，帶領孩子們同心敬拜上帝。
儘管時局艱困，危難險阻，但上帝的慈愛與保守從不離開我們。雖然所有實體聚會都被迫暫停，但我們改用線上的方式，仍然可以互相關懷、聯絡，舉行會議、推動事工…這一切都證明上帝的保守與眷顧，常與我們同在，並賜下夠用的恩典。
歷經半年左右的努力，國內疫情控制漸趨穩定，9月中旬，我們慢慢恢復實體禮拜，各牧區小組也回到教會聚集，小會經過多次討論，克服各種困難，感謝主恩典，我們在10月24日順利舉行第28屆長執改選，並順利選舉出2位長老和5位執事，加入長執服事團隊。
2022年對我大直教會而言，是非常重要的一年，這一年的上半年，我們預備好下半年啟動的「組織更新計畫」，延續去年開始所構思的，按照屬性不同及教會發展的實際需要，將原本的七大部門：「禮拜部、宣教部、財務部、教育部、關懷部、總務部、影音部」重新調配、組織，成為「財務部」、「行政部」（所屬有禮拜組、總務組、人資教育組、資訊媒體組）、「牧養部」（所屬有成人牧區、青年牧區、兒童牧區、裝備課程）及「事工部」（所屬有宣教節慶組、你有影響力組、舊友關懷組、禱告動力組、聖樂崇拜組），
我們深信上主永遠掌權，儘管世界快速變遷，但我們深信上帝的愛是從不改變的，上帝的同在永遠是我們最大的盼望、安慰與依靠。我們滿懷感恩，對未來的日子，我們將透過禱告尋求上帝的心意，並求聖靈指教我們，好讓我們有可聽的耳、順服的心、行動的手和溫柔的靈，作主耶穌基督的門徒，帶領更多人認識福音，完成我們被交託的使命。
2023年1月起，組織會正式啟動。而組織會的設置，是從2020年就開始構思，我們期待興起更多弟兄姐妹投入事奉上帝的行列，因此即便是輪休中的長執，也有機會在組織會裡，繼續奉獻我們的才情、時間和恩賜，而我們也確實發現，弟兄姐妹都能按著神的心意，盡心、盡力、盡意、盡性，在服事中操練恩賜，並且體會神豐盛的恩典和奇妙的旨意，並出人意外的平安，以致於我們能做神百般恩賜的好管家。
展望2024年，我們以「成為眾人的祝福」為年度目標。而主要推動的，在於信徒靈命的進深。我們相信透過各級RPG的推動，一定能帶起教會火熱禱告的風氣，主日信息的整體規劃，期待在神話語的大能、福音的大能，都能經歷新一波的復興浪潮；教會袖的訓練，不管是長執團隊、小組長，我們都渴望神蹟奇事得以不斷在我們當中，我們相信，我們的主不僅要使我們的生命得的更豐盛，更要讓我們真實地去經歷到，神使我們的生命成為更多人的祝福。
2024年，本會全體弟兄姊妹、長執、牧者，在上帝慈愛引領與滿滿賜福之中，可說是走過豐盛的一年。各牧區、小組推動RPG，持續幫助弟兄姊妹們建立起禱告、彼此代禱、互相祝福的風氣。兒童主日學蒙式教育，在週四上午進行。敬拜讚美學校逐漸成熟，鼓勵許多弟兄姊妹投身於各種樂器的學習，並沈浸於音樂的洗禮之中，期待不僅是樂器操作技巧上的精進，也在學習的過程中，與每一位授課老師們一起教學相長。
教會各類課程的推動，更使大家在信仰基礎上紮根、建造，對主更有信心，也更明白自己是上帝眼中的寶貝。9月起，本會正式成立「活耀牧區」，透過執行團隊的規劃、禱告尋求，聖靈奇妙大能的帶領之下，多年來的「社區松年大學」成功轉型，活動課程內容從每週二～每週四，每天上午均設計各類課程（烏克麗麗、木箱鼓、體雕健身、生活知識、健康新知、歡樂歌唱班、乒乓球運動等），而週五則打造為「重新得力俱樂部」，讓主內長者和社區朋友們一起在主堂裡，透過「真理傳講、見證分享」為主要聚會性質及其內容。每一堂都獲得極大的迴響，感謝神透過我們的生命，成為多人的祝福。
在同工一起討論、同心禱告之中，於12月上旬的同工會裡，將週間課程正式命名為「活力學苑」，期待長者們「活到老、學到老，身體健康、靈魂興盛、心靈喜樂」。為著我們一起領受的豐富恩典，我們向天父上帝獻上滿心的感謝。
2025年，我們的教會向著「同心同行」的目標，喜樂奔走那擺在我們前面的道路。這一年裡是相當關鍵的一年，因為在聖靈的帶領之下，我們一起為神國圖謀大事，並看見上帝透過我們同心服事這個屬於我們的世代，來看見神的榮耀！正如耶穌曾對祂的門徒說：「…你將要看見比這更大的事。」（約翰福音1：50）
感謝神，本會各牧區的牧養，逐漸發展各自的「特色事工」，如兒主發展出「蒙式」、青年為「敬拜讚美學校」、活耀牧區發展「重新得力」事工。相信各個牧區在眾同工們同心同行之下，在聖靈澆灌我們所需的能力裡，我們的教會朝向健康、快樂、成長的方向，滿有信心與盼望，一起奔跑這條永生的道路。
檢視2025一年以來，各項事工的規劃、執行與檢討，我們清楚看見神就在我們當中，並且樂意賜福給那些獻上自己，樂意為主所用的人，天父上帝果然也照著祂豐盛的應許，使我們在服事中不斷成長，因著這樣的看見，2025年10月10日～11日在萬里聖經園區，我們舉辦了「領袖共識營」，迫切禱告，彼此代求，我們知道上帝在2026年所給我們的使命，是在本會異象的基礎之上，朝向鼓勵同工更多追求靈命成長，甘心為神國打美好的仗，在這樣的期許之下，我們清楚2026年的目標是「人人皆祭司，大小可服事」，一方面回應改革宗的美好傳統：萬民皆祭司；另方面也盼望幫助弟兄姊妹們，看見服事的意義和價值，體會領人歸主那屬天的喜樂，如同活水從心中湧流，並且渴慕這樣的喜樂長存心中，透過體會上帝的憐憫與恩典，更確信確知我們的生命已經與永生真神連結，享受在地如同在天的永恆福份。
願我們獻上自己的全人和全心，以感恩為祭獻給上主，一生為主所用。
